中心多年来一直致力于科技型中小企业的孵育服务与管理,2010年、2011年和2015年,原上海市火炬高技术产业开发中心、原上海市高新技术成果转化服务中心和原上海技术交易所相关职能相继并入中心。新的功能定位和职能明确了中心既是培育科技型中小企业的孵化器,又是全市科技企业孵化器网络及大学科技园的协调服务机构,同时为全市科技型中小企业提供创新创业服务,为全社会创造科技创业的公共服务环境。
中心作为市科委直属机构,还承担上海市高新技术成果转化项目认定、促进高新技术成果转化和产业化的政策服务、技术转移服务、科技金融服务、上海市中小企业技术创新资金项目、小巨人企业项目等有关科技产业化项目和众创空间、孵化器建设专项资金的统筹安排及管理;国家级科技企业孵化器、大学科技园、众创空间的申报与推荐等多项管理职能。